charlesdarwin
2018-01-04 17:40:13 UTC
Selles Biopythoni õpetuses kirjeldatakse, kuidas importida mitmekordse järjestuse joondust lillakas värvitoonis (XMFA: laiendatav mitme fasta vorming). Nii et impordisin mooduli AlignIO:
kaustast Bio import AlignIOalignment = AlignIO.read (open ("alignment.xmfa"), "lilla")
kuid kuvatakse järgmine tõrge:
ValueErrorTraceback (viimane kõne viimati) <ipython-input-30-396e54791d7a> in <module> () ---- >.1 (joondamine = /Users/cr517/Documents/alignment.xmfa"),"mauve")/Users/cr517/anaconda/lib/python3.6/site-packages/Bio/AlignIO/__init__.pyin loe (käepide, formaat, seq_count, tähestik ) 422 iteraator = sõelumine (käepide, vorming, seq_count, tähestik) 423 proovige: - > 424 esimene = järgmine (iteraator) 425, välja arvatud StopIteration: 426 esimene = puudub / Kasutajad / cr517 / anaconda / lib / python3.6 / site- paketid / Bio / AlignIO / __ init __. pyini sõelumine (käepide, vorming, seq_count, tähestik) 366 seq_count = seq_count) 367 muu: - > 368 tõsta ValueError ("tundmatu format '% s' "% format) 369 370 # See tekitab mõningaid üldkulusid ... oodake, kuni laseme selle parandamiseks Pythoni 2.4. ValueError: Tundmatu formaat 'lillakas