Kaalutud geeniekspressioonivõrgu analüüsis (kasutades WGCNA) on müra filtreerimiseks soovitatav pehme läve võimsus. See seisneb korrelatsiooni tõstmises teatud arvuni. Selle jõu otsustamiseks hinnatakse mõnede jõudude jaoks skaalavaba topoloogiat. Funktsioon selle printimiseks:
Toide SFT.R.sq kalle kärbitud.R.sq mean.k. mediaan.k. maks. 1 1 0,9300 3,110 0,996 2960,0 3060,0 39702 2 0,7510 1,010 0,964 1750,0 1780,0 29003 3 0,1730 0,258 0,806 1170,0 1150,0 22804 4 0,0942 -0,183 0,713 833,0 782,0 18705 5 0,3800 -0,463 0,777 623,0 553,0 660,06 0603 6 55,0 7 0,6270 -0,797 0,872 381,0 312,0 11908 8 0,6870 -0,910 0,900 307,0 241,0 10509 9 0,7270 -1 000 0,918 252,0 189,0 93610 10 0,7490 -1,080 0,928 210,0 150,0 84111 12 0,7850 -1,190 0,948 150,0 98,0 69312 14 0,80 -1,360 0,968 84,0 45,6 49714 18 0,8410 -1,410 0,973 65,2 32,1 42915 20 0,8490 -1,450 0,977 51,6 23,0 375
Soovitus KKK s näitavad, et SFT.R.sq väärtus peaks olema mõistlike volituste korral suurem kui
0,8 (alla 15 allkirjastamata või allkirjastatud hübriidvõrkude korral ja vähem kui 30 allkirjastatud võrkude puhul)
ja keskmine ühenduvus alla sadade.
Teised on energiat kasutanud nagu müra filtreerimist, hoolimata skaalavaba topoloogiast palju sobib. Valiksin esimese jõu isegi siis, kui keskmine ühenduvus on tuhandetes, kuna skaalavaba topoloogia sobivus on üsna kõrge, kuid kalle teeb mind hämmeldavaks.
Kuidas peaks olema pehme läve võimsus valitud?
Näite põhjal küsimus