Proovin BLAST + -i abil kaugotsingut käitada.
Saan otsingute õigeks toimimiseks käsureal järgmiste käskudega:
blastp - päringu proteiinid.fasta -remote -db nr -out proteiinid_nr.txt -outfmt 6 -väärtus 1e-30
Sooviksin siiski meile kaugandmebaasi pealkirjaga "Mikroobivalgud nr-st" mida kasutataksegi mikroobide plahvatuse otsimisel, mis pääseb NCBI saidilt BLAST-i.
Püüan leida õiget koodi, et pääseda sellele andmebaasile lihtsalt "nr" asemel.
Kas on olemas nimekiri erinevate andmebaaside koodidega?
Täname ette