Blast teatab E-väärtustest, kuid lühilugenud kaardistajad kaardistamise omadustest. Kas need on samad asjad? Kas neid saab teisendada? Kui ei, siis miks blast ei anna aru kaardistamise kvaliteedist, samas kui lühilugenud kaardistajad ei teata E-väärtustest?
E-väärtus ja kaardistamiskvaliteedid on kaks väga erinevat asja.
E-väärtus on "parameeter, mis kirjeldab nende tabamuste arvu, mida võib" oodata "juhusliku nägemise korral konkreetse suurusega andmebaas ". Lisateavet leiate siit: https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?CMD=Web&PAGE_TYPE=BlastDocs&DOC_TYPE=FAQ#expect
Kaardistamine kvaliteet on katse hinnata tõenäosust, et etteantud lugude antud alus on õigesti kaardistatud teatavasse kohta võrdlusgenoomis. Erinevad joondajad arvutavad kaardistamiskvaliteete väga erinevalt, nii et nende joondajate vahel pole lihtsat viisi võrrelda. Kuid üldiselt arvestatakse kaardistamise kvaliteedis näiteks: (i) baaskõne kvaliteeti; (ii) viite kordusstruktuur; (iii) joondusalgoritm; (iv) kas lugemisel on kaardistatud paar; (v) midagi muud, mida kaardistustarkvara autor arvas, võiks aidata.
E-väärtused ja kaardistamise omadused mõõdavad seetõttu kahte põhimõtteliselt erinevat omadust, millel on väga erinev kasutus.